Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI9

NPNT, Nephronectin, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPNTQ6UXI9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPNTQ6UXI9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms