Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRAIDQ6UW56 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms