Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMBQ6PCB8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EMBQ6PCB8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms