Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMOD2Q6P5Q4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
LMOD2Q6P5Q4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMOD2Q6P5Q4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms