Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LLGL2Q6P1M3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LLGL2Q6P1M3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LLGL2Q6P1M3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LLGL2Q6P1M3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LLGL2Q6P1M3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LLGL2Q6P1M3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LLGL2Q6P1M3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LLGL2Q6P1M3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LLGL2Q6P1M3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LLGL2Q6P1M3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LLGL2Q6P1M3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LLGL2Q6P1M3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LLGL2Q6P1M3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LLGL2Q6P1M3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LLGL2Q6P1M3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LLGL2Q6P1M3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LLGL2Q6P1M3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LLGL2Q6P1M3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LLGL2Q6P1M3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms