Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAVIN1Q6NZI2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAVIN1Q6NZI2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms