Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBEC3HQ6NTF7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms