Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRNIPQ6NTE8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms