Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRNP1Q6NT89 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNP1Q6NT89 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms