Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPH2Q6IBW4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCAPH2Q6IBW4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms