Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCTP1Q6DN14 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms