Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
INTS3Q68E01 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
INTS3Q68E01 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms