Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCTD16Q68DU8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD16Q68DU8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms