Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
E4F1Q66K89 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
E4F1Q66K89 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E4F1Q66K89 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms