Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF6Q5VXH4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms