Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GARNL3Q5VVW2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GARNL3Q5VVW2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms