Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF20Q5VTR2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF20Q5VTR2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms