Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC38Q5VT99 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms