Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC18Q5T9S5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC18Q5T9S5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms