Protein–RNA interactions for Protein: Q5T442

GJC2, Gap junction gamma-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC2Q5T442 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJC2Q5T442 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJC2Q5T442 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJC2Q5T442 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJC2Q5T442 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJC2Q5T442 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJC2Q5T442 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJC2Q5T442 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GJC2Q5T442 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJC2Q5T442 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJC2Q5T442 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJC2Q5T442 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms