Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SNAPC4Q5SXM2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SNAPC4Q5SXM2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
SNAPC4Q5SXM2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SNAPC4Q5SXM2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SNAPC4Q5SXM2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SNAPC4Q5SXM2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SNAPC4Q5SXM2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
SNAPC4Q5SXM2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SNAPC4Q5SXM2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms