Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A3Q5K4L6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms