Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRMPD3Q5JV73 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms