Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A13Q5J8X5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms