Protein–RNA interactions for Protein: Q562R1

ACTBL2, Beta-actin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBL2Q562R1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTBL2Q562R1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTBL2Q562R1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms