Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HSD17B12Q53GQ0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms