Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC38Q502W7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms