Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM259Q4ZIN3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMEM259Q4ZIN3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms