Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC25A52Q3SY17 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC25A52Q3SY17 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms