Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSR1Q2NL82 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR1Q2NL82 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms