Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC96Q2M329 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms