Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MSMPQ1L6U9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSMPQ1L6U9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MSMPQ1L6U9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSMPQ1L6U9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MSMPQ1L6U9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms