Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTGISQ16647 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGISQ16647 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms