Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FXNQ16595 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FXNQ16595 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FXNQ16595 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FXNQ16595 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FXNQ16595 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FXNQ16595 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FXNQ16595 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FXNQ16595 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FXNQ16595 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FXNQ16595 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FXNQ16595 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FXNQ16595 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FXNQ16595 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FXNQ16595 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FXNQ16595 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FXNQ16595 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FXNQ16595 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FXNQ16595 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FXNQ16595 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FXNQ16595 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FXNQ16595 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FXNQ16595 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FXNQ16595 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FXNQ16595 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FXNQ16595 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FXNQ16595 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FXNQ16595 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FXNQ16595 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FXNQ16595 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FXNQ16595 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FXNQ16595 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FXNQ16595 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FXNQ16595 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FXNQ16595 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FXNQ16595 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FXNQ16595 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FXNQ16595 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FXNQ16595 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FXNQ16595 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FXNQ16595 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FXNQ16595 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FXNQ16595 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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FXNQ16595 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FXNQ16595 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
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FXNQ16595 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FXNQ16595 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FXNQ16595 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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FXNQ16595 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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FXNQ16595 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FXNQ16595 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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FXNQ16595 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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FXNQ16595 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FXNQ16595 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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FXNQ16595 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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FXNQ16595 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FXNQ16595 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FXNQ16595 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FXNQ16595 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FXNQ16595 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FXNQ16595 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FXNQ16595 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FXNQ16595 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FXNQ16595 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FXNQ16595 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FXNQ16595 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FXNQ16595 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FXNQ16595 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FXNQ16595 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FXNQ16595 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FXNQ16595 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FXNQ16595 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FXNQ16595 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FXNQ16595 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FXNQ16595 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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