Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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SGCAQ16586 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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SGCAQ16586 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCAQ16586 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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