Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA3Q16281 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA3Q16281 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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