Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
VPS72Q15906 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS72Q15906 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
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