Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIP13Q15645 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms