Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIP10Q15642 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIP10Q15642 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms