Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRADDQ15628 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRADDQ15628 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRADDQ15628 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRADDQ15628 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRADDQ15628 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRADDQ15628 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRADDQ15628 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRADDQ15628 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRADDQ15628 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRADDQ15628 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRADDQ15628 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRADDQ15628 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRADDQ15628 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRADDQ15628 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRADDQ15628 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRADDQ15628 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRADDQ15628 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRADDQ15628 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRADDQ15628 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRADDQ15628 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
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