Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF1Q15526 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF1Q15526 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SURF1Q15526 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF1Q15526 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF1Q15526 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF1Q15526 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF1Q15526 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF1Q15526 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF1Q15526 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF1Q15526 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF1Q15526 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF1Q15526 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF1Q15526 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF1Q15526 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF1Q15526 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF1Q15526 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF1Q15526 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SURF1Q15526 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF1Q15526 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms