Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN3Q15417 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNN3Q15417 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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