Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDK3Q15120 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK3Q15120 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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