Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCAPD2Q15021 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPD2Q15021 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms