Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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LAPTM4AQ15012 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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LAPTM4AQ15012 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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