Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MDC1Q14676 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDC1Q14676 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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