Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL9A3Q14050 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL9A3Q14050 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL9A3Q14050 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL9A3Q14050 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL9A3Q14050 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL9A3Q14050 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL9A3Q14050 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL9A3Q14050 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL9A3Q14050 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL9A3Q14050 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COL9A3Q14050 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL9A3Q14050 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL9A3Q14050 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COL9A3Q14050 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
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