Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF9Q13886 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms