Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDX39BQ13838 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDX39BQ13838 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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