Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD4Q13485 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
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